肛瘺術半年之內，尤其是3個月之內瘢痕較硬、彈性差，有針扎式疼痛或攣縮式疼痛，此時建議用軟化瘢痕的藥膏盡早軟化，減少瘢痕引起的疼痛。肛瘺治療原則為敞開整個瘺管，幫助里邊壞死組織脫落，分泌出膿液，最后填充肉芽組織，待皮膚爬上瘺管才能徹底治愈。最終會形成瘢痕，但是瘢痕大小取決于瘺管的情況，具體如下： 1、高位肛瘺瘢痕較重，因為破壞的括約肌較多； 2、低位肛瘺瘢痕較輕； 3、復雜性肛瘺瘢痕因切開位置較多，故瘢痕較重； 4、單純性肛瘺瘢痕較少，但依然存在瘢痕。 瘢痕與正常組織不同，相對較硬，沒有正常組織的彈性。但隨著時間推移，一般瘢痕在3-6個月以后會與正常組織基本融合，性狀、彈性基本與正常組織接近，此時就不會引起各種不適。