普通超聲彩超可以檢查胃腸道，但臨床并不常用。因為胃腸道有較多氣體，超聲彩超在氣體較多的情況下觀察效果較差。目前隨著內鏡的進一步發展，超聲內鏡應用比較普及。如果發現胃內有病變，可以在超聲內鏡下進行超聲探查，從而觀察病變來源、層次，以及侵犯范圍，是超聲內鏡的優勢。因此普通彩超較少用于胃腸道檢查，有些二級醫院或者部分三級醫院在病人無法進行CT或者胃鏡檢查時，為明確胃內是否有結石等病灶，有時會采取彩超，從而探查胃壁大致厚度，胃腔內有無異物。現在進行胃腸檢查多半采取內窺鏡等檢查方式，如果要進一步明確腸壁、胃壁的情況，可以采取超聲內鏡檢查。