國產疫苗與進口疫苗從功能上或者有效性、安全性來講，基本沒有區別，都比較安全、可靠，均是經過科研人員以及臨床醫生的驗證。其他區別可能是效價不同，進口有二價、四價、九價疫苗，國產有二價、四價疫苗，疫苗是根據不同廠家、不同效價和分型而定，可以打1劑次、3劑次，要根據疫苗的具體說明注射。目前部分國產疫苗也只打1針，可能效價只有二價，即針對HPV16型和HPV18型，誘發宮頸癌的病毒以HPV16型和HPV18型比較多見，即將最重要的病毒類型預防后，實際上即預防多數的宮頸癌。疫苗的選擇需要依據個人情況，如年齡會有限制，從安全性和有效性來講，國產疫苗與進口疫苗相差無幾。