沙利度胺治療口腔潰瘍有副作用，主要副作用是致畸，青年男女吃藥如果懷孕，可能會生出畸形的孩子，還可能吃藥后犯困、肢端發麻，甚至導致深靜脈血栓、便秘，部分患者會出現藥疹。沙利度胺治療口腔潰瘍一定是在醫生指導下用藥，由醫生開藥才能用，出現藥物副作用，醫生對藥物副作用能夠判斷，及時停藥。只有在這種情況下才能夠應用沙利度胺來治療口腔潰瘍。千萬不要自行選用沙利度胺來治療口腔潰瘍，因為藥物副作用比較嚴重。如果自己買藥對上述問題不了解，則容易出現副作用，不能夠及時停藥和應對，有時會造成永久損傷，比如肢端發麻，如果不能夠馬上停藥，仍繼續吃，肢端發麻不可逆，所以沙利度胺一定要在醫生指導下應用。