嬰兒心肌酶高是否能自愈要根據具體情況決定，具體如下：1、嬰兒心肌酶輕度升高：這部分升高的心肌酶可以自然愈合，不需要特殊處理；2、疾病導致心肌酶升高：如上呼吸道感染導致心肌細胞功能受抑制，隨著感染的控制，心肌酶可以自行恢復正常；3、心肌酶升高明顯：肌鈣蛋白已經出現不同程度的升高，提示心肌細胞可能有變性、水腫、壞死，此時無法自愈，同時要加強警惕，帶孩子來醫院做心臟其他方面檢查，比如完善心電圖，明確孩子是否出現各種心律失常，做心臟超聲檢查，明確心臟結構、大小、功能有無出現異常。一旦發現孩子心肌發炎，導致心肌酶出現異常升高，要積極處理，使炎癥在短時間內得到有效控制，盡量讓孩子經過積極的治療之后痊愈，甚至部分得到較好的控制，盡量不遺留嚴重、永久的心臟相關后遺癥。