包皮手術安全系數較高，一般風險不大，但并非無風險，因為做任何手術均有一定風險。包皮手術在門診中屬于微創小手術，手術時需麻醉，如果對麻醉藥過敏，可出現嚴重問題，但過敏幾率較低。包皮局部血流豐富，手術時可出現出血，包皮局部組織也較松軟，所以出血后可形成大血腫，尤其是在晚上做完包扎后，因為晚上夜勃或早晨晨勃時血流增加，勃起后可能出現疼痛，部分患者還可出現出血。如果出血處理不當，可形成局部血腫，或引起表面的低血壓出血，但發生幾率較低。除外，如果手術后不注意，如排泄時濕潤紗布或在手術中無菌操作不嚴，均可增加感染幾率。較多男性患者在意包皮局部外觀，而手術時如果切得不整齊，可影響外觀甚至影響功能。