直腸息肉有很多檢查方法可以發現，最簡單的方法即為醫生指診。如果是有經驗的醫生，特別是肛腸科醫生，指診是最寶貴的診斷方法，所以幾乎對于所有肛腸科的病人需要進行直腸指診，可以發現不同情況的直腸息肉有增生的情況。 使用時間較長的輔助檢查方法是進行鋇灌腸檢查，鋇灌腸檢查在結果上可表現出有充盈缺損。充盈缺損是指息肉占據一部分位置，使鋇無法填充顯影，缺失一部分影像，影像缺失的大小即說明息肉的大小。但是檢查存在局限性，有時候可能較小的息肉無法發現，因此目前已經逐漸被最清晰、最直觀的結腸鏡檢查替代。 目前無論是電子結腸鏡還是光學結腸鏡檢查，對于發現直腸息肉都是最好的診斷和檢查方法。進行結腸鏡檢查的相對痛苦比較小，如果結腸鏡檢查能夠得到普及，結直腸息肉和早期結直腸癌發現的幾率將會非常高。如果存在腸道癥狀或者存在家族病史，在40歲以前一定要進行一次結腸鏡體檢。