CT用X線進行成像，X線有輻射，是電離輻射，頭部CT就本身輻射劑量并不太大，但是X線電離輻射對于人體影響有累積效應、隨機效應。 累積效應是達到一定量之后，人體會出現一些反應，頭部CT一次檢查量遠遠達不到。隨機效應是有一些器官或者人群對輻射特別敏感，比如頭部的眼睛，所以在做頭部CT包括其它部位CT的時候，一般會做保護，盡量不讓射線輻射眼睛、甲狀腺、腺體敏感器官。 另外，對孕婦或者兒童來講，盡量減少CT檢查，因為對于孕婦來講可能影響到胎兒發育。對于兒童來講，CT輻射可能對以后腫瘤發生有關系。目前文獻報道如此。