甲狀腺惡性腫瘤的治療主要跟病理分型、有關，有些Ⅳ期甲狀腺惡性腫瘤可能沒有辦法做特別的治療。 現在有中草藥，包括免疫治療。未分化癌沒有手術機會，因為發展非常迅速，但是分化型的癌癥，甲狀腺乳頭狀癌以及濾泡狀癌，這兩種分型手術效果非常好，包括髓樣癌，手術也是唯一的辦法。到了術后需不需要做同位素治療，要根據每個人的情況、年齡、分期，根據病理最后淋巴結是否轉移來看是不是需要做術后碘-131治療。所以，甲狀腺癌的手術治療針對分化型甲狀腺癌即乳頭狀癌以及濾泡狀癌為主。