流感的治療分為對癥治療和抗病毒治療。對癥治療高熱的患者可以進行物理降溫或者應用解熱藥物，咳嗽、咳痰嚴重的患者可以給予止咳祛痰的藥物，還可根據缺氧的程度采用適當的方式進行氧療。抗病毒治療重癥或有重癥流感高危因素的患者應盡早給予抗流感病毒治療，不必等待病毒檢測結果，發病48小時內進行抗病毒治療可減少并發癥、降低病死率、縮短住院時間；發病時間超過48小時的重癥患者，依然可以從抗病毒治療中獲益；非重癥并且沒有重癥流感高危因素的患者，發病48小時內，評價風險和收益后，也可考慮抗病毒治療。抗病毒治療的藥物主要是神經氨酸酶抑制劑，對甲型和乙型流感均有效，最常用的是奧司他韋，奧司他韋應在出現癥狀的48小時內開始治療，成人的劑量每次75mg，每天2次，療程5天，重癥的患者療程可適當延長。奧司他韋耐受性良好，常見的不良反應有輕度惡心、嘔吐，大多在用藥后2天內發生，在治療過程中會逐漸減輕或消失。