頭痛、腹瀉，主要可能是以下疾病：1、急性感染性疾病：頭痛和腹瀉如果同時發生，在急性期通常屬于急性感染性疾病，并且很多患者都經歷過這樣的臨床過程，突然開始腹瀉，并且同時伴有頭痛。患者此時要迅速測量體溫，明確是否出現發熱，如果發熱、腹瀉、頭痛同時出現，建議患者盡快到專業的醫院通過專業的門診，得到正規的診斷和治療；2、慢性疾病：另外部分患者出現的腹瀉、頭痛屬于慢性的過程，即反復出現頭痛、腹瀉；3、功能性疾病：比如部分患者的腹瀉，屬于排便習慣改變，通常與自身的情緒相關，比如很多患者因為焦慮、緊張，從而導致頭痛，頭痛之后又出現消化道的癥狀，比如腹痛和腹瀉，并且為反復多次出現。尤其到醫院反復就診排除器質性疾病的患者，需要考慮為功能性問題所致，有時患者就需要在醫院得到治療，或者部分患者需要調節自己的身心，達到逐漸恢復正常的狀態。