焦慮癥會引起腸胃的很多癥狀，如反酸、惡心，呃逆、腹脹、腹痛、便秘、腹瀉、腸道激惹度增高等。因為以上不適癥狀與消化道各種疾病的表現非常相似，以至于通過觀察或主觀描述，很難跟器質性胃腸病進行區別。焦慮會引起植物神經功能紊亂失調，而胃腸道又受植物神經功能支配，因此當植物神經功能紊亂時，受植物神經功能系統支配的器官也會紊亂，表現為各種類型的不適，而且可能與器官的器質性疾病，如潰瘍、胃食管反流、腫瘤所致的主觀不適、外在表現幾乎一模一樣。因此，需鑒別是否為焦慮癥導致，需進行完整仔細的檢查。