膝蓋后的囊腫通常是腘窩囊腫，腘窩囊腫分兩大類，少見情況與腱鞘囊腫一樣，是后方肌肉之間摩擦導致腱鞘囊腫類似的腘窩囊腫，通常患者可以手術切除。但是多數的腘窩囊腫是由于膝關節內部有病變，尤其是膝關節的退變、軟骨的損害、半月板的損害導致關節積液壓迫，到后方形成的囊腫，實際上做腘窩囊腫的切除不恰當。應該根據膝關節內部的情況，患者應該做關節鏡手術、截骨矯正手術，還是關節置換手術，在做手術的過程中，將膝關節腘窩囊腫的內口打開做內引流，腘窩囊腫也就消失。所以膝蓋后邊的囊腫通常是腘窩囊腫，多數情況下是繼發于膝關節內病變。患者應該先治膝關節內的病變，同時再治囊腫。不僅是治腘窩囊腫，即使患者通過手術切除后，除非是少見情況類似腱鞘囊腫的腘窩囊腫，通常切除后，復發率較高。