腦梗死和腦血栓對于神經科醫生可能給出同樣的診斷，現在一般將其稱為腦梗死。但是血栓更強調原因，腦梗死更強調結局。 通常常見的腦梗死原因是動脈粥樣硬化而導致的血栓，常見因素有高血壓、高血糖、高血脂而引起血管的狹窄、斑塊。如果斑塊脫落，可以造成血管的栓塞；栓塞也常見于心源性因素，比如心臟瓣膜、心律失常或心肌病導致心內的血栓而引起的血源性栓塞。 此外，心源性栓塞可以導致急性腦梗死，還有很多的情況導致腦梗死，比如血管夾層、血管炎癥，或身體處于高凝狀態。而罕見的遺傳性因素均可以導致腦梗死發生。