不建議圓錐角膜患者做近視眼手術，因為圓錐角膜是角膜病變，角膜中央區會隆起、變薄，會產生度數改變及不規則散光。 圓錐角膜患者的角膜可能會變得較薄，做近視眼手術，如角膜切削激光手術，有可能因對角膜進一步切削而使之更薄，會加重圓錐角膜引起的危害，甚至造成角膜穿孔，這種危害通常難以控制。 眼內晶體植入手術可能可以做，但由于圓錐角膜是進行性進展的疾病，裝上晶體后，目前的不規則散光還是不能糾正，所以視功能難以得到有效糾正。隨著疾病進展，甚至有可能需要做角膜移植手術。 這些情況都會對術后的視覺質量、視功能、度數產生一定影響，因此不建議圓錐角膜患者去進行角膜切削或眼內晶體植入手術。圓錐角膜患者可以在做角膜交聯術的同時戴硬性角膜接觸鏡，來糾正不規則散光，并控制圓錐角膜進展。