霉菌性陰道炎不影響懷孕，孕期容易合并許多炎癥，其中霉菌性陰道炎經常會發生，因為孕期能增加霉菌性陰道炎的發生，但胎兒在宮腔內，霉菌性陰道炎在陰道內，二者互相不影響。除非霉菌性陰道炎沒有得到及時控制，破壞了陰道微生態環境，引起了混合型感染，如霉菌性陰道炎合并其他的厭氧菌感染或其他致病微生物，如衣原體、支原體等綜合感染，會造成宮頸的嚴重感染，造成胎膜早破，此時可以造成宮內感染，才能影響懷孕。霉菌性陰道炎在懷孕期間可以用藥物治療，如制霉菌素、克霉唑等陰道上藥，也可以用陰道乳酸桿菌增加陰道的微生態環境，增加陰道的免疫力，去除霉菌性陰道炎。