四維彩超主要應用于胎兒畸形檢查，通常根據臨床上醫學檢查目的檢查，在早期、中期、晚期都可以做。早期11-14周可以做1次，檢查頸項透明層，到了中期，16-24周看胎兒心臟畸形，結構畸形，到了妊娠6個月，即24-28周，篩查其他一些畸形。 如果是有問題的胎兒，可能會1個月查2次，因為畸形需要反復檢查，在不同的醫院也可能會做好幾次，只要對胎兒沒有傷害，四維超聲檢查也沒有限制，但一定要有醫學檢查目的，雖然不限制，但是不提倡多次檢查。