男性可注射HPV疫苗，但目前由于HPV疫苗主要針對女性，為預防相應高危亞型的人乳頭瘤病毒持續性感染，導致宮頸癌以及癌前病變發生。注射HPV疫苗主要預防宮頸癌前病變、癌變發生。此角度而言如果男性注射疫苗，益處較少，由于男性無宮頸構造，并不涉及宮頸癌變。如果男性注射HPV疫苗后，對于防止由于高危亞型感染而導致的男性生殖器官的腫瘤，有一定價值。但由于男性生殖器官表面鱗狀上皮較厚，較難被HPV持續感染導致癌變而發生意外。男性可通過注射HPV疫苗免受高危亞型的HPV感染，未來對于性伴侶有保護作用。目前四價疫苗、九價疫苗除針對高危亞型外，還會針對低危亞型，如HPV6和HPV11。如果感染上述兩種亞型，將會導致出現尖銳濕疣。如果男性注射此類HPV疫苗后，可以減少多數由于HPV6和HPV11型感染而導致的尖銳濕疣發生。