先天性腸閉鎖手術風險具體如下： 1、麻醉風險：麻醉會出現窒息或者引起氣道損傷； 2、吻合口瘺：手術要把兩端腸管接通，最主要的并發癥是吻合口瘺，如果接上去長不好，大便都漏在肚子里，需要再次手術，手術是進行造瘺，待其恢復較好，約三個月左右，再把造瘺口還納回去； 3、切口感染：因為新生兒皮膚抵抗力差、營養不良都會引起切口感染、切口裂開； 4、遠期并發癥：吻合口狹窄、腸管粘連。