多數骶管囊腫不需要手術治療，骶管囊腫和蛛網膜囊腫相同，均為一種單純在顱腔里或者椎管腔里形成的結構，屬于先天性疾病，為惰性的變異結構，不需要手術干預，因為它對周圍神經、馬尾神經，中樞、椎體結構不會產生明顯破壞。 患者發現疾病以后隨訪即可，3-5年拍一次腰椎磁共振來觀察骶管囊腫的變化和發展。多數患者疾病終身不會發展，因此骶管囊腫無需過分手術干預。如果骶管囊腫為先天性畸胎瘤、脊膜膨出等原因導致，為繼發的骶管囊腫，可以進行手術干預。