腎囊腫一般不會自愈，腎囊腫通常是膨大腎小管的憩室，這種憩室不斷膨大后就形成了腎囊腫，這是腎囊腫的形成過程。腎囊腫形成后一般有3個結局，即維持相對穩定、不再繼續增大或者不再快速增大；緩慢長大；腎囊腫可能會合并有出血、感染，里面有鈣化，或者形成結石等。對于維持相對不變的腎囊腫，可以不予以處理；對于緩慢增大的腎囊腫，主要是要明確其增大的快慢、程度，另外有沒有壓迫等；對于囊內有出血、感染、鈣化的腎囊腫，也要定期觀察，如果有明顯的感染，病人出現發熱等癥狀，這時可能還要給予病人抗感染治療。對于單純性的腎囊腫，通常處理原則是如果單側＜3個、大小＜5cm，向外生長的腎囊腫，一般不給予特殊治療，就是臨床觀察；如果腎囊腫長得較大或者向內生長，可能會壓迫到腎臟的組織，這時通常要求給予外科處理。