激光祛疣會復發，局部的疣體隨著激光治療被祛除，但是人乳頭狀瘤病毒會留存于患者的皮膚表面，或者是黏膜層。當抵抗力下降時，如過于勞累、工作壓力過于大，沒有休息好，或者是妊娠期，此時皮膚或者是黏膜層出現刮擦的微創面，有可能再次被人乳頭狀瘤病毒所感染。或者是碰觸不潔的毛巾，或者是碰觸到病人的體液，或者是分泌物都有可能會引起繼發感染。此時有可能會出現疣體的復發，但是原位復發的幾率不大。當患者身上出現扁平疣或者是絲狀疣，要早期進行激光祛除，以免在自身創面，或者是皮膚，或者是黏膜出現播散，導致疣越來越多，導致進行治療時，需要的創面恢復期會相應變化，患者舒適度可能也會有較大改變。所以激光治療越早做，瘤體越少，花費越小，恢復也越快，治療的舒適度也越高。