流行性出血熱的潛伏期和病毒的傳播、復制時間有關，所以流行性出血熱從流行病學調查的角度，一般城市里的流行性出血熱的出血潛伏期時間是2-7周，在山區更短，其和病毒含量有關。 流行性出血熱往往開始時潛伏期或者病毒孕育期在2-7天，典型的臨床表現是乏力、有低燒，流感樣癥狀全身酸痛，甚至有些人有消化道表現，比如腹瀉。過了潛伏期，病毒的致病量達到一定載量以后，開始出現典型表現，如高熱，出現血管損傷、出血、液體滲出、低血壓休克、腎功能衰竭。流行性出血熱的主要病理表現是血管破壞，有些患者心臟會出現出血，顱內會有水腫，腎臟、腎小管壞死。小便早期會有尿蛋白出現，中后期尿白細胞、紅細胞會出現，血肌酐升高，腎功能衰竭。