男性小便時出現尿道疼痛的癥狀，可能有以下幾個原因：1、泌尿系統的感染性疾病：是引起男性排尿時出現尿道疼痛的常見原因，主要包括膀胱、尿道或者鄰近器官的病變，比如尿道炎，可以分為淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。尿道炎患者的癥狀表現為尿頻、尿急，排尿時或者是排尿結束的時候，出現尿道恥骨上或者會陰部疼痛，同時在患者的尿道口會排出大量黃色或者是白色的膿性分泌物。男性的急性前列腺炎或者是慢性前列腺炎、精囊炎等疾病，也會引起排尿的時候尿道疼痛的癥狀；2、泌尿性結石：比如膀胱結石、尿道結石或者是輸尿管末端的結石，由于結石刺激尿路黏膜，也會引起排尿時尿道疼痛的癥狀；3、理化因素刺激：膀胱或者尿道受到一些理化因素的刺激，比如男性在喝水比較少的時候尿液濃縮，尿液中的物質刺激尿道黏膜，就會引起排尿時尿道疼痛的癥狀；4、其他：男性的尿道異物或者是化學性的膀胱炎等，也會引起小便時出現尿道疼痛。