男性患者排尿時尿道刺痛，應根據具體疾病選擇治療方式：1、尿道炎：如果男性出現尿道刺痛，可以進行尿常規檢查，如果尿常規檢查有白細胞，提示有尿道炎癥，患者可以選用抗生素治療，如頭孢類、喹諾酮類、四環素類藥物等，進行抗感染治療；2、慢性前列腺炎：表現為尿道刺痛，伴有尿頻、腹痛等癥狀，需要選擇針對慢性前列腺炎的藥物進行治療，如α受體阻滯劑，松弛尿道、下腹部、盆腔緊張的肌肉，改善癥狀；3、單純尿道刺痛：可以多飲水、多排尿，不要久坐，多運動。可應用對癥的藥物，如非甾體類消炎鎮痛藥、中成藥等。經過檢查診斷后，患者應在醫生的指導下選擇藥物治療。