如果牙齦旁邊長肉疙瘩，應盡早到正規醫院口腔科進行檢查，依據原因進行相應治療，主要情況如下：1、牙周疾病：主要是牙齦膿腫或根分叉病變造成，需要進行潔治、刮治，去除牙石，去除根分叉地區的炎癥、肉芽組織，控制炎癥后，瘺孔可以閉合；2、根尖炎癥：需要進行根管治療，去除已經壞死的牙髓，再進行多次根管換藥，炎癥控制后再進行根管預備、沖洗、充填，再修復牙冠缺損。還要根據根尖病變大小，判斷是單純進行根管治療，還是在根管治療后再配合根尖切除手術，只有根尖炎性病變被徹底控制后，根尖周圍瘺孔才能慢慢閉合。