臨床上鼻竇炎經過積極規范治療后，很少產生并發癥。但部分患者鼻竇炎病情較為嚴重，若未及時治療，炎癥通常擴散較快，從而波及眼眶及顱內，導致患者出現眼球突出、腫脹、固定及視力下降等，甚至部分患者可出現高熱、劇烈頭痛等癥狀。若慢性鼻竇炎未得到及時控制和治療，可使鼻黏膜功能減退，從而出現頑固性鼻塞、嗅覺減退、嗅覺喪失，甚至引起鼻息肉等并發癥。 此外，若患者鼻竇炎由過敏性因素導致，鼻部周圍器官通常也可出現過敏癥狀，包括眼睛、耳朵、咽喉等。較少見的嚴重鼻竇炎，如急性侵襲性真菌性鼻竇炎進展迅速，嚴重時可對患者生命帶來危害，故需積極治療。