雖然目前近視眼手術較高效、安全，但仍然存在一定后遺癥，主要包括以下幾種：1、感染：可能由于手術因素，導致術后感染，也可能是術前存在感染，術后感染的癥狀加重，通常是手術過程中，激光損傷神經末梢所導致；2、角膜瓣復位不良：對制瓣的激光手術而言，可能會發生角膜瓣的復位不良，包括瓣下感染、瓣下混濁等；3、其他后遺癥：如術后視力回退、眩光、視覺質量下降等，視覺質量下降指雖然患者的視力達到1.0，但整體視覺質量不佳，看東西會感覺不舒服。