少部分結膜炎會自愈，但大部分結膜炎無法自愈，需要依賴藥物，具體情況如下：1、可以自愈：少部分毒力較弱的細菌及病毒感染造成的結膜炎，還有非特異性結膜炎、過敏性結膜炎、變異性結膜炎，病情發生的程度較輕微，通過休息，健康飲食，避免吃辛辣、刺激食物，一般都能自愈；2、不能自愈：大部分結膜炎感染較重，或感染輕但細菌毒力較強，通過機體抵抗力自愈較難，需依賴于藥物治療。通過抗病毒藥物、抗真菌藥物、抗擊阿米巴藥物，甚至還需聯合眼表修復藥物，如促進角膜和結膜上皮細胞增殖愈合藥物、堿性成纖維細胞生長因子、表皮細胞生長因子或自體血清，有時會依賴手術如羊膜移植以促進結膜上皮、角膜上皮愈合。