當腎結石位于腎盂內未形成梗阻時，多數患者并沒有明顯的臨床表現。形成局部梗阻的時候，患者可能會出現腰部的疼痛，疼痛一般比較局限，患者疼痛的性質是以隱痛、鈍痛為主。只有腎結石進入到輸尿管內，形成急性的梗阻的時候，患者才會出現明顯的腎絞痛癥狀，而典型的腎絞痛癥狀，患者表現為脊肋角和腰部的劇烈刀割樣疼痛，并且疼痛會向下腹部放射。男性可以放射到陰莖頭和睪丸等部位，而女性可以放射到陰蒂。同時患者會出現血尿癥狀，多數患者也就是90%的患者，血尿表現為鏡下血尿，而只有10%的患者會出現肉眼血尿，血尿發生的原因是結石的活動，導致黏膜的損傷。如果結石形成梗阻以后合并了感染，患者會出現發熱、寒戰等全身癥狀，嚴重的時候會出現尿膿毒血癥，甚至出現感染性休克。如果是孤立腎形成的梗阻，或者是雙側梗阻，患者可能會出現急性或慢性的腎后性腎功能不全。