角膜潰瘍是角膜炎病情發展階段，是由壞死角膜上皮和基質脫落形成。此時可通過藥物治療及患者自身抵抗力增強，角膜潰瘍一般會逐漸愈合。潰瘍區角膜上皮再生前彈力層和基質層的缺損逐漸由瘢痕組織修復，根據角膜潰瘍深淺愈合以后會有不同厚薄的瘢痕，例如角膜云翳、角膜斑翳和角膜白斑。角膜白斑如果位于角膜中央則會嚴重影響患者視力，目前多采用角膜移植手術改善患者視功能。 角膜潰瘍早期通過藥物可以控制，經過藥物治療發現治療效果較差，建議患者盡早進行手術，手術一般包括羊膜移植、結膜瓣遮蓋及角膜移植術。角膜潰瘍累及深基質層一般建議患者行板層角膜移植術，潰瘍累及全層甚至穿孔建議患者行穿透性角膜移植術。