手指骨髓炎的治療原則是膿腫引流、病灶清除，進行抗感染治療，首要的治療為引流。如果病灶位置比較接近末梢，感染比較嚴重，可以通過切除遠端控制感染，如果是中段的骨髓炎，現在治療方法也非常多，可以通過手術切除中間的感染病灶，進行植骨的融合治療。 如果患者感染灶比較小，比較靠近遠端，進行殘端的修整，但是如果患者全手指感染非常嚴重，通過幾次清創和負壓治療以后，如果感染長期無法控制，呈進行性加重，也可以通過手指截肢進行治療。大多數患者僅會進行保指手術的清創治療，而且在95%以上的患者，可以通過保指清創治療實現骨髓炎的控制，而不需要進行截指的治療，以避免可能會影響后期手部功能和日常生活。