當患有紅斑狼瘡的時候，首先要評估狼瘡的活動度，臨床通常分為輕度、中度和重度。如果單有紅斑、皮疹、口腔潰瘍、漿膜炎、關節炎、光過敏，而沒有系統損害，即腎臟、血液、神經等系統損害的時候，認為是輕型狼瘡。此時可能口服DMARDs藥物，比如慢作用藥，如羥氯喹。如果有關節癥狀，可口服甲氨蝶呤、來氟米特。如果合并有口腔潰瘍，可以用沙利度胺等藥物。 當出現系統損害的時候，狼瘡已經到中重度，需要用激素和免疫抑制劑治療。但存在個體差異，根據每個人的不同情況進行治療。如果出現尿蛋白、尿潛血的時候，用激素加嗎替麥考酚酯治療。如果出現血液系統受損害，用激素合并環孢素A治療。還有一個情況，即出現狼瘡危象的時候，可危及到生命，此時用大劑量激素沖擊治療和生物制劑治療。