甲型H1N1流感指的是甲型流感中H1N1亞型，流感病毒表面有一層病毒的包膜，包膜上有糖蛋白的凸起，分為血凝素和神經氨酸酶，根據內部抗原和核蛋白的不同，把流感分為了甲型流感、乙型流感，以及丙型流感病毒。又根據外部抗原的抗原性不同，也就是神經氨酸酶和血凝素的不同，將甲型流感分為了不同的類型。血凝素是H，神經氨酸酶是N，H有15種類型，N有9種。甲型流感中極易發生變異主要是H和N的變異，H1N1就是甲型流感變異后的一種亞型。甲型流感通常會引起流感的大流行，而乙型流感也會發生變異，一般會引起小流行或者散發，而丙型流感基本不發生變異。