如果在肛門部長肉芽，首先若是在進行肛門直腸手術以后，肛門部位長肉芽，這種情況主要是傷口生長出現異常的表現。通過檢查肉芽不是很大，輕微高出者可以使用高滲鹽水外敷治療。如果肉芽比較高，突出者可以使用剪刀將其剪平。 其次若是未進行手術治療者而出現肛門肉芽的情況，這考慮是患者出現外痔、混合痔、肛乳頭肥大、直腸息肉一類疾病。 肛乳頭肥大是因為肛門炎癥的刺激，使肛門周圍的肛乳頭的芽胚增生出來，形成肛門周圍的肉芽，多數為良性病變，其中一部分有惡變可能，建議將肥大肛乳頭切除，外痔、混合痔、直腸息肉多數情況下服藥無效，建議患者應當盡早手術切除。