舌頭分叉有可能是先天性的因素所造成，還有可能是免疫系統紊亂，或者是內分泌紊亂所引起的后天改變，可能還與舌頭損傷有一定的關系。因此，造成舌頭分叉的病因很多，若要找尋導致此現象的具體原因，需觀察患者口內的情況以及舌頭分叉形態、程度、位置等。另外，還要觀察患者舌系帶、咬合關系、口腔的情況等綜合而定。導致舌頭分叉的原因，若是先天性因素，并且是舌系帶過短所引起，可通過舌系帶延長術以及相關的一些手術，進行相應矯正。若是由于全身系統性疾病，在口腔的表現，例如內分泌系統紊亂或免疫系統低下的患者。此類原因所引起的舌頭分叉，需明確導致患者舌頭分叉的病因，將患者的全身因素治愈，才可能解決問題。