如果有些肝癌非常微小，超出肝彩超檢查的分辨率比如1-2mm、2-3mm的肝癌。這時候彩超可能不能發現肝癌，而彩超報告可能顯示為正常。這種情況下彩超結果報告正常，就不能夠排除患者沒有肝癌。彩超是一種既經濟又簡便的檢查方法，對于肝癌高危人群的篩查，彩超已經列為必查的項目，非常的方便、便宜。每半年檢查一次，結合甲胎蛋白的檢查能檢查出很多小肝癌。小肝癌指＜5公分的肝癌，對于1-2mm、2-3mm的肝癌不能被彩超發現。這時有比較好的檢查，如果彩超發現可疑的肝臟結節，可以做CT增強或者磁共振增強。CT增強和核磁共振增強分辨率更高，可能可以看到更加微小的肝占位、肝癌的情況。肝癌的診斷除影像學檢查即彩超、CT、磁共振外，還可以進行腫瘤標志物的檢查，包括甲胎蛋白、異常凝血酶原、巖藻糖苷酶以及甲胎蛋白異質體等。有很大部分肝癌患者腫瘤標志升高，結合影像學的檢查就可以比較準確的找到肝癌。對于診斷非常不清楚、有疑問的患者，可以進行肝穿刺的病理檢查，讓病理科醫生做出最終的病理診斷。