肝囊腺瘤的治療是通過外科手術將其切除，以獲得根治性治療的效果，肝囊腺瘤在臨床上并不多見，部分囊腺瘤最初被誤診為肝囊腫，囊腺瘤和囊腫的區別有時在影像學上并不典型，包括腹部CT、核磁，不一定都確診。囊腺瘤有時在手術中，通過外科手術觀察，發現囊腫壁稍厚、囊內液體為黏液性，其通過手術中快速病理才能夠確診。較大的肝囊腫、囊腫短期內快速增長，影像學提示囊壁傷后囊內有分隔，囊內液體密度較高時，患者需要警惕可能有肝囊腺瘤。肝囊腺瘤若只是通過外科手術進行開窗，術后囊壁仍可以分泌大量液體，而引起疾病遷延不愈，或存留腹腔內積液。肝囊腺瘤存在一定的癌變風險，因此確診肝囊腺瘤，建議通過外科手術將其完整切除，以避免發生癌變。