有的卵巢囊腫做完以后，可能0.5-1年或者2-3年以后會復發，即再長囊腫，有時長在同一側，有時長在對側。每次都要問，上次手術的位置、情況，此次囊腫與上次是否為同，這些都要去問。比如畸胎瘤等最常見的卵巢囊腫，手術以后確實有可能復發。在先天性的情況中，如果母親給其留1顆種子，則其長1個畸胎瘤，如果有2顆種子則有可能長2個，如果留5個則有可能長5個，如果1次將幾個腫瘤都切除，有可能也只做1次手術，其情況不一。觀察其是否復發時，要看比如畸胎瘤則要看上次長在哪側。黏液性囊腫，有時剔除腫瘤沒有將其完整拿走，因為患者年輕，如果切掉1個卵巢則不復發，但是卵巢功能就少一半，懷孕機會則少一半。所以有時也會有復發，復發以后再長出包，大部分是因為做B超又發現，至于疼痛，巧克力囊腫復發可能會有疼痛、性交痛等癥狀，而其它囊腫通常無特別癥狀。