包皮上有小疙瘩的疾病如下：1、珍珠疹：為常見疾病，粟粒大小和針尖大小，呈白色，密集分布，沒有融合；2、皮脂腺異位：皮脂腺長在陰莖冠狀溝，是黃色粟粒大小的扁平丘疹，生長較慢；3、尖銳濕疣：冠狀溝內感染HPV，生長尖銳濕疣，呈小疙瘩樣、菜花狀、雞冠狀。一般屬于傳染病，通過接觸傳染，要及時到醫院處理和治療，包括激光治療、藥物處理；4、腫瘤：比較少見，建議到醫院檢查、處理。珍珠疹和皮脂腺異位是正常結構，無需處理，如果自我感覺影響美觀，可以用激光治療，一般不建議處理。