過敏性結膜炎目前臨床上常用的查過敏原方法是針刺法，也就是用針將過敏原一個個通過針刺進入真皮下，之后表現為小丘泡，來看是否能引起機體的過敏反應，來判斷是否是過敏原。過敏性結膜炎在臨床上并不是很建議查過敏原，除非非常嚴重的情況下，會進行過敏原檢查。因為要進行過敏原檢查，就需要在機體皮膚表面扎幾十個，甚至上百個點，比如塵螨是一個過敏原點，雞蛋是一個過敏原點，或者是某種青菜是過敏原點，因此，有可能會漏掉大部分的過敏原。針刺試驗只可能檢查機體是否對某些物質過敏，檢查內容有限。在臨床上，過敏性結膜炎常見的過敏原是塵螨、蛋白類食物、外界植物，比如漆樹葉子，主要還是塵螨，以及空氣中的污染物，例如PM2.5。而過敏性結膜炎與過敏性鼻炎經常一起發生，經常由過敏性鼻炎引起過敏性結膜炎。