E6E7陰性在進行宮頸癌篩查時，仍然建議進行高危亞型HPV檢測。人乳頭瘤病毒在感染一段時間之后，可能已經與宿主細胞發生了基因整合，這個時候會有一些早期轉錄蛋白產生，此時會檢測到E6E7陰性。不過即使檢測E6E7陰性，也不一定代表沒有發生高危型人乳頭瘤病毒感染，很可能剛剛只出現了HPV感染，還沒有達到讓E6E7蛋白產生的地步，所以在早期感染的時候有可能查不到E6E7陽性。簡言之，E6E7一般是感染了一段之后出現的一個產物。為了安全起見，進行宮頸癌篩查時，實際上更側重于高危亞型人乳頭瘤病毒分型的檢測，進行分型檢測后能夠知道到底有沒有HPV感染。通過這樣的檢測方法，第一能夠知道是否感染，第二能夠知道感染的亞型，需要根據宮頸液基細胞學結果，或者根據高危亞型感染陽性的不同亞型作出診斷，比如16、18亞型。無論宮頸以及細胞學檢查結果如何，應該進行陰道鏡下活檢，不用考慮E6E7是陽性，還是陰性。