在月經周期不同的時間內孕酮高低各不相同，通常在月經前半期孕酮較低，而在月經后半期孕酮會逐漸增高，甚至可以達到整個月經周期的高峰。而如果是懷孕后，妊娠黃體可以繼續分泌孕激素，這時孕酮的含量進一步升高，所以孕酮高的意義通常并不明顯。通常孕酮低有明確的臨床意義，孕酮高表明黃體功能較好，通常不能用來指導臨床，只有當孕酮比較低時才提示卵巢有問題，或沒有達到排卵階段孕酮才會降低。如果懷孕后孕酮增高是正常的現象，說明胚胎較健全以及黃體功能較好，而孕酮低可能會對胚胎有一定的威脅，需要予以糾正。