兒童先天性心臟不好會有以下影響：1、影響生長發育：因為本身有先天的心臟結構或者功能異常，這部分兒童可能在生長發育過程中會出現體格發育落后，比如身矮或者體型偏小；2、肺部感染：最常見的先天性心臟病是左向右分流型，伴有肺血的明顯增多，或者這部分先天性心臟病的兒童免疫功能較低，容易合并肺部感染。因此在季節交換時容易反復患有氣管炎或肺炎，出現呼吸衰竭或心力衰竭；3、血栓：部分兒童因為先天性心臟病，心臟內有缺損，可能會導致心腔內血栓的形成或者心腔內有細菌的菌栓形成。一旦出現感染，播散至血液中會引起敗血癥，導致感染性心內膜炎。如果感染的栓塞一旦從心臟脫落，可能會栓塞其他臟器，出現相應臟器的血栓或者心腔內出現血栓。一旦心腔內的血栓脫落，也可以出現其他臟器的栓塞，比如最常見的腦梗塞或者其它重要臟器梗塞的表現。