部分扁平疣會出現瘙癢，部分扁平疣沒有感覺，通過感覺判斷是否為扁平疣并不科學，瘙癢不是唯一的判斷標準。扁平疣出現瘙癢，通常代表著疾病正在發展，當疾病處于進展期時，可能出現瘙癢，幾天后局部出現扁平疣樣損害，即疾病在發展期間出現瘙癢的感覺。另外扁平疣在進食刺激性飲食時也會出現瘙癢，如辣椒、油膩食物，以及火鍋、海鮮、牛羊肉，喝酒，經常吃這類刺激性食物和發物，扁平疣處也會出現皮膚瘙癢。扁平疣伴有瘙癢的情況，還可以見于部分敏感體質，本身屬于敏感體質的患者，同時又伴有扁平疣，扁平疣刺激皮膚，可以出現瘙癢的情況。隨著搔抓可以誘發新的皮膚病，如過敏性皮膚病，還可能誘發新的扁平疣，扁平疣在發作期間出現同形反應，如果出現瘙癢并進行搔抓，會出現新的扁平疣損害，通常呈現線條狀，或隨著抓痕而出現皮損。