雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊說明書上，并未標有明確的不良反應。雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊屬于益生菌制劑，主要由長型雙歧桿菌、嗜酸乳酸桿菌、糞鏈球菌等對人體有益的腸道固有菌群組成，對人體通常無害。此藥可維護人體腸道正常細菌菌群平衡，抑制病原菌的生長，防止便秘、下痢和胃腸障礙等，同時在腸道內合成維生素、氨基酸和提高機體對鈣離子的吸收，降低血液中膽固醇水平防治高血壓，改善乳制品的耐乳糖性提高消化率，增強人體免疫機能，以及預防抗生素的副作用等好處。但作為藥物，雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊并不建議長期服用，通常患者服用7-14天癥狀即可緩解，而對于病情特殊的患者可遵醫囑服用。對于健康人群建議日常生活中，可以常喝含有益生菌的奶制品，以調理腸胃功能，同時需要注意的是雙歧桿菌三聯活菌腸溶膠囊應在2-8℃冷藏保存，以免降低活菌活性繼而使藥物失效。