萘普生和布洛芬，都屬于非甾體類的抗炎藥，屬于同一類藥物，因此作用基本相同，具有解熱、鎮痛、抗炎的主要功效，因此兩種藥物，一般無法比較哪個更好。從療效上而言，萘普生對于解熱、鎮痛、抗炎作用，較布洛芬好。但從不良反應上而言，萘普生對于胃腸道的不良反應，以及全身系統性的不良反應，較布洛芬高。如果用于普通的退熱，無論是感冒感染，或其他原因引起的發熱，萘普生的退熱作用，較布洛芬好，與布洛芬到底使用哪個，一般區別并不大。如果用于治療風濕、類風濕，或骨性關節炎等疾病，萘普生的治療效果，較布洛芬好。布洛芬對藥物的耐受性較萘普生高，因此在疾病時候，選擇何種藥物，一般由醫生根據病人病情、個人的體質，以及不良反應進行選擇。如果患者年齡較大，對不良反應的耐受較低，選用布洛芬較好，如果需要比較劇烈的藥物才能夠退熱，萘普生的效果會較好，而且使用1-2次，不良反應較小。如果需要長期使用，布洛芬較好，對于風濕、類風濕萘普生效果較好，如果短期使用，二者沒有太大區別。