腎結石對大便存在間接性影響，因為腎結石除腎絞痛外，還易造成腹脹、惡心、嘔吐、無食欲，在此類狀況下，容易導致大便干燥、秘結或長時間沒有大便。腎結石需要和急腹癥進行鑒別，如果腹痛病人出現里急后重，反復排便，則胃腸炎的可能性更大。而腎結石的病人除有典型的腎絞痛、腰背疼痛難忍、尿頻、尿急、尿痛，還會有惡心、嘔吐等消化道癥狀，在發作時因為進食較少，可引起大便秘結，但不會出現腹瀉。在做腎結石診斷時，通過平片或CT檢查會發現在結腸區域有很多儲存的大便，是因為腎結石刺激腹腔內的神經，影響腸道蠕動。對于部分大便秘結的病人，可以在治療腎結石的同時，應用治療便秘的藥物，幫助大便盡快排出。