舌根囊腫是囊性的胞質，為良性的腫塊。舌根小囊腫通常無需處理，或只剔除囊腫就可以有較好的治療效果。舌根癌是惡性的腫瘤，舌根癌分為舌根的高分化鱗癌、中分化鱗癌、低分化鱗癌、未分化鱗癌。惡性程度高的未分化鱗癌，手術效果也較差，對放療也不敏感。低分化鱗癌可以進行放療，也可以經過手術治療，手術加放療是低分化鱗癌的標準治療方式。 所以，舌根鱗癌和舌根囊腫有本質區別，處理方式和手段也完全不同，一旦診斷舌根鱗癌，必須積極行早期手術切除。