全麻的副作用主要是可能在術中出現反流、誤吸、躁動或血壓波動的現象，術后出現惡心、嘔吐等癥狀。若全麻患者進行插管或穿刺，相應部位會出現疼痛的癥狀。需要注意兒童由于肝腎功能或器官發育不完全，可能會有相對缺氧的情況。有些小孩，比如3歲以內的小孩，要做手術的時候可能存在肝腎功能或器官發育不完全，可能會有缺氧等，此種相對較多見的副作用。全麻是讓中樞神經系統功能得到暫時性的抑制，是可逆的狀態。臨床中全麻使用的藥物副作用越來越少，出現問題也都是可控、可逆的。